Enrichment tanulmányok szükségessé számítás szekvenálás adatok alapján határozza meg a fedezet . Ezt elsősorban génszekvenálás laboratóriumokkal igénylő integrált DNS minta-előkészítés és az előre gazdagodás összevonását . Számítási szekvenálás lefedettség használata szükséges változókat , amelyek magukban foglalják az átlagos szekvencia lefedettség, az összes célzott alapok és a gazdagodás hatékonyságot. Performing ez a számítás történik megadásával az összes ezeket a változókat egy egyenlet . Utasítások
1
Írd le az egyenlet kiszámításához használt átlagos szekvencia lefedettség. Ez úgy néz ki mint a kívánt lefedettség osztva az átlagos normalizált lefedettség. Ha a kívánt lefedettség 10x és az átlagos normalizált lefedettség 0,2 , akkor az átlagos szekvencia lefedettség 50 : Matton 2
Írd le az egyenlet kiszámításához használt összeget szekvenálás . Ez így fog kinézni ( összes célzott bázis) ( átlagos szekvenálás lefedettség) /( dúsítás hatásfok ) = mennyiség szekvenálás .
3
Plug in 62 MB a ” teljes célzott bázisok ” és 0,65 a ” gazdagodás hatékonyságát. ” Add hozzá a szekvenálás fedezeti összeget 50x és az egyenlet így fog kinézni (62) (50) /0.65 . Az eredmény az egyenlet lesz 4.8 GB szekvenálás adatok .
